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猪副粘病毒(蓝眼病病原)分离株N基因的实时定量RT-PCR应用分析

来源:湖南新南方养殖服务公司 2015-05-28 16:44:57| 查看:

中国养猪网讯:

  引言


  猪蓝眼病(BED)是墨西哥的地方流行性疾病,20世纪80年代初首次报道,研究已发现有3种基因型组与疾病的各种临床表现有关。多采用血凝抑制试验(HI试验)和病毒分离诊断猪副粘病毒(PorPV)。此外,细胞系对感染的敏感性取决于病毒基因组,是可变的。可用巢式RT-PCR检测病毒基因组,但该法只在做流行病学调查时检测LPMV(拉帕丹密考克病毒)原型株时使用。该法是否能够检测其他猪副黏病毒毒株还是未知的。由于该法检测灵敏度不高,且缺乏足够的量化方法,因而很有必要研发出更快速、更灵敏的PorPV毒株检测方法。本研究的目的是建立一种可以检测3种不同型PorPV毒株基因组的诊断方法,即实时定量RT-PCR(qRT-PCR)检测方法,并且对该法的有效性和敏感性进行评估。用实时定量RT-PCR检测实验感染PorPV的猪,同时对该方法的灵敏度和特异性也进行了评估。


  材料和方法


  选用1980-2003年间分离到的9个PorPV分离株来验证qRT-PCR试验。先将病毒接种于GMK细胞中置于96孔板中培养。实验所用培养试剂都是经过细胞病变检测、血凝和间接免疫荧光试验评估筛选出来的。用Reed和Muench法来计算滴度,表示为50%组织培养感染剂量(TCID50)。为了便于统计,将滴度转化为log10值。给8只6周龄的生长猪鼻内接种4 mL PAC-3型病毒株(1×106 TCID50/mL),于接种前2天到接种后17天之间分别采集鼻腔拭子和口腔拭子各47份,然后用美国QIAamp公司的病毒RNA™提取试剂盒对感染病毒的培养物上清液和拭子样品进行RNA抽提,备用,操作按试剂盒要求规范进行。提取到的RNA用于后续PorPVN基因的定量分析,以上即为进行实时定量RT-PCR的步骤。


  结果


  该技术能检测到病毒的极限含量是102滴度。当PorPV的RNA浓度达到TCID50的百分之一时就能被检测出来。表1列出了9个PorPV毒株用定量病毒RNA检测法和病毒滴定法两种方法之间的显著差异。在本次实验中,与病毒分离方法相比,qRT-PCR检测阳性样品的敏感性更高(87.1-83.9%)。

 

  注:*,**,***表示数值显著差异(P<0.05)。a表示数值表示成Log10;SEM,平均值的标准误差;HA,血凝反应;TCID50,50%组织培养感染剂量;CPE,细胞病变效应;IIF,间接免疫荧光法。


  结论与讨论


  实时定量RT-PCR检测方法的高敏性和产生结果的快捷性,为墨西哥彻底消除蓝眼病带来了很大的帮助。我们也相信,该方法的应用将有助于减少蓝眼病在其他国家的传播。

 

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