当前，并没有针对农村自繁自养养猪户的特异的免疫程序。合理的免疫程序取决于每个猪场的感染压力、疫病种类、生产方式、管理水平和疫苗种类以及疫苗的质量。相信这里所说的农村自繁自养猪场应该是指母猪存栏数量较少，生物安全措施较薄弱、技术力量较弱的猪场，这种自繁自养猪场与规模猪场相比，母猪与仔猪的免疫同样重要，此处可就常见病的防疫程序推荐如下，由于农村自繁自养场疫苗的运输经过较多的环节，因此要更加注意疫苗的质量和有效期。
猪瘟：脾淋苗或细胞苗，种母猪，一年三次普免；后备猪，配种前间隔一个月免疫两次；生长猪，4 周首免，8周龄二免；伪狂犬：
g E基因缺失弱毒疫苗，种母猪，一年4 次普免；后备猪，配种前间隔一个月免疫两次；生长猪，9周龄首免，1 2 周龄二免；
蓝耳病：种母猪，分娩后免疫一次（弱毒苗）；后备猪，配种前间隔一个月免疫两次；生长猪，3 ~ 4 周龄免疫一次(弱毒苗)；
萎缩性鼻炎: 种母猪，每胎分娩前4 ~ 6 周注射一次；
喘气病：灭活苗，1 ~ 2 周龄首免，3 ~ 4 周龄二免；细小病毒：种猪，每胎分娩后免疫一次；后备猪，配种前间隔一个月免疫两次；乙型脑炎：种猪，在蚊虫季节来临之前一个月免疫一次；
口蹄疫：种猪，每年免疫三次；后备猪，配种前间隔一个月免疫两次；生长猪，40 日龄首免，70 日龄二免，100日龄三免；
副猪嗜血杆菌：种猪，一年三次普免或每次产前1 个月免疫一次；后备猪，配种前间隔一个月免疫两次；以上疫苗，除喘气病疫苗和副猪嗜血杆菌疫苗外，种公猪一年免疫两次。
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