使用口腔液体样本用于PRRSv序列分析检测的成功率分析
来源：湖南新南方养殖服务公司 2015-06-04 15:23:58| 查看：次
中国养猪网讯：
对PRRS进行序列分析有助于对其进行流行病学研究。口腔液体样本相对于血清样本更易获取，但其检测成功率低。本文旨在分析仔猪和育肥猪的口腔液体样本(OF)用于序列分析的成功率，分析其Ct值的分布，并探讨Ct值与猪日龄之间的关系。
方法材料
采样时间从2010年11月到2011年5月，采样日龄区间为保育猪(8-9周龄)和育肥猪(15-16周龄)。共采集452份口腔液体样本，其中保育猪279份，育肥猪173份。所有的样本均送至爱荷华州李大学的兽医诊断实验室做序列分析。序列分析成功率按全部样本和不同生长阶段分别做计算。试验中各种Ct值的实验成功率用柱状图表示。同时设计模型，包含Ct值、猪生长阶段，以成功率作为变量做二进制Logistic回归分析。此外，本实验还对保育猪和育肥猪最适的Ct值进行了评估。
结果
总的成功率和不同生长阶段成功率如表一
序列分析成功的实验口腔样本Ct平均值要显著低于分析失败的实验(P<0.01)(31.28 VS 32.24)。Logistic回归分析显示Ct值、生长周期与口腔样本成功序列分析之间存在明显联系(P<0.10)。
图2表示保育和育肥猪的ct值新的观测方法的二元回归预测分析。
结论分析
实验显示，OF样本用于序列分析成功率较低，Ct值是影响成功率的因素之一，此外还包括样本运输、处理、酶抑制剂、取样保存时间等等。这些因素还需要进一步分析，以便了解为何在相同的Ct值下，实验可能出现成功和失败两种结果。
此外，实验发现，Ct值为30.5时，保育猪的序列分析成功率可达50%，而育肥猪的仅为35%(图2)。这些实验结果可以为临床采样提供参考。更重要的是，需要进一步的实验来确定口腔样本用于序列分析实验是否可行。
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